С 15 июля 2020 года по 17 февраля 2021-го занимал должность заместителя председателя Гослесагентства. Член Аграрной партии Украины.

До 2007 года работал в Государственной лесной инспекции в Киевской области. После занял должность инженера в местном лесхозе, пять лет работал лесничим, затем – директором Прилуцкого лесохозяйственного предприятия. С 2012-го по 2020 год возглавлял ГП "Нежинское лесное хозяйство", и за этот период предприятие стало одним из лучших в Черниговском ОУЛОХ.

Также прошел производственную практику в Великобритании. В 2020-м Болоховца назначили начальником Черниговского областного управления лесного и охотничьего хозяйства.

С июля 2020 года был заместителем главы Государственного агентства лесных ресурсов Украины, а в феврале 2021 года возглавил это ведомство. 4 мая 2023 года работал и. о. генерального директора ГП "Леса Украины". С 6 октября 2023 года является генеральным директором этого государственного предприятия.

Его деятельность в качестве руководителя Гослесагентства и ГП "Леса Украины" постоянно сопровождается громкими скандалами и расследованиями, связанными с коррупционными делами. В июле 2025 года ГБР даже сообщило Юрию Болоховцу о подозрении в незаконном обогащении, а суд назначил залог в 91 млн грн. Но, несмотря на это, чиновник остается ключевой фигурой в руководстве предприятия.